近日，“橡胶树等主要热带作物功能基因组学研究”创新团队负责搭建的橡胶树HeveaDB基因组数据库平台（hevea.catas.cn）上线运行，并在国际橡胶研究与发展委员会（IRRDB）各成员国间开展测试工作。经过1个月的测试，数据库平台各项指标保持稳定，运行可靠，达到预期效果。
近些年来，随着基因组测序技术的进步，已有四个国家（马来西亚、泰国、中国和日本）独立绘制并公开发表了橡胶树基因组草图(Rahman et al. 2013; Tang et al. 2016; Lau et al. 2016; Pootakham et al. 2017)，其中以我所完成的草图版本质量最高。同时还产生了大量转录组数据，这些数据亟需一个整合的数据平台来储存、分发和共享，并进行二次挖掘利用。2017年在印尼雅加达召开的IRC2017国际橡胶会议上提出要搭建橡胶树基因组数据中心的计划。在IRRDB理事会上热科院代表经过争取，获得了牵头搭建橡胶树基因组数据中心的任务，并由“橡胶树等主要热带作物功能基因组学研究”创新团队承担开发工作。经过几个月的努力，创新团队成功搭建了橡胶树基因组数据库HeveaDB初期版本，并在2018年4月底在国内外开展试运行测试。
HeveaDB数据库主要储存了橡胶树4个版本的基因组草图、1个遗传图谱、142个转录组数据、49235条EST序列、30200个基因注释、12个基因家族的信息，以及5049个IRRDB 1981’野生种质资源材料和18328个魏克汉材料信息，并以我所完成的热研7-33-97品种的基因组数据为参考基因组，进行了二次挖掘和分析，进行可视化展示。主要特色功能有：基因组Gbrowse和Jbrowse可视化浏览、基因表达谱的heatmap展示和检索、共表达网络展示等。
橡胶树HeveaDB基因组数据库平台（截图）
在数据库测试期间，项目开发成员还编写了使用说明，并通过微信平台进行宣传，提高了数据库的易用性。
经过1个月的试运行，HeveaDB数据库访问量达到1600余次，共有来自中国、马来西亚、法国、巴西、日本、印度、越南、英国、印度尼西亚等10余个国家和地区的200多位独立访客点击访问了HeveaDB数据库，并反馈了意见和建议。下一步，将根据建议在数据库易用性、后基因组数据分析等方面进行二次开发和功能升级，并根据橡胶树基因组研究进展及时更新数据内容。
HeveaDB数据库由橡胶研究所程汉研究员牵头搭建，相关工作得到了热科院“橡胶树等主要热带作物功能基因组学研究”创新团队和我所基本业务费项目国际合作专项的资助。
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