发布时间:
2019-12-19
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11月12日，中国热带农业科学院生物所功能基因研究组在国际著名学术期刊Journal of Experimental Botany杂志上在线发表了题为“Large-scale analysis of cassava transcriptome reveals the impact of cold stress on alternative splicing”的研究论文。本文揭示了木薯耐干旱、对低温敏感的机理，为热带作物提高抗逆性育种提供了新方向。
木薯是全球重要薯类作物，提供全球至少6亿人口的食品和工业原材料。木薯具有耐干旱、对低温敏感的特性，对其响应非生物胁迫的机理开展研究，对培育高产、抗逆木薯新材料具有重要指导意义。该研究结合三代全长转录组、链特异性RNA测序技术，首次发现木薯约1/3的蛋白质编码基因在低温胁迫下产生了4万多个可变剪接转录本，其数量及比例远高于目前已经报道的其它植物物种。这些可变剪接转录本中内含子滞留型占比高达53%以上。降解组测序结果显示70%以上的可变剪接体被降解，而并没有被翻译成功能蛋白。基因功能聚类分析表明，被降解的可变剪接基因主要参与了温度胁迫响应、蛋白质翻译后调控等重要生物学过程，这一结果恰好解释了木薯对低温敏感的原因，为今后木薯的抗逆育种提供了新的思路和方向。
该团队李淑霞博士为本研究论文的第一作者，曾长英博士、李文彬博士和海口实验站的程志号博士等参与了该项研究工作，彭明研究员为通讯作者。该研究得到国家自然科学基金和国家重点研发计划等项目的资助。
文章链接：https://doi.org/10.1093/jxb/erz444
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